硅藻泥刷墙面比较环保，因此硅藻泥墙面的清洁成为了重点，给硅藻泥这种特殊墙面做保洁工作是需要一定的技巧的，主要是要区分一些污渍的来源，采用不同的方式：
一、比如硅藻泥墙面上的挂尘和积灰清洗的方式是，平常多往硅藻泥墙面省喷水，因为墙壁挂尘的主要原因是天气太过干燥，浮尘携带静电吸附所引起的，因硅藻泥对空气湿度具有良好的调节平衡作用，壁材表面是亲水的，可以有效减少静电现象，所以与其它材质饰面相比较，硅藻泥墙面壁更加不容易挂尘、具有一定自清洁功能。也可以采用毛掸轻掸或用干净的抹布轻轻擦试硅藻泥墙面上的浮尘，或者是使用吸尘器吸尘，都是非常有效的方法。
二、如果是硅藻泥墙面上不小心沾上了咖啡或者橙汁等带色液体，是在污点没有完全渗透和扩散之前及时擦拭干净，浅浅的痕迹可以使用含氯漂白剂的干净的抹布轻轻的在脏了的硅藻泥墙面试擦即可去除。如果已经渗透扩散而且污渍较大，则需要在其彻底干透后局部刷水性底油，再用硅藻泥配套的同色硅藻泥涂刷遮盖即可，也可以理解是脏一块，重机关报补一块。
三、对于硅藻泥墙面上小的手印、较硬或字迹等清洁的方式也比较简单，可以使用软橡皮、硬橡皮或细砂纸等简单工具在脏了的硅藻泥墙面上轻轻地拭擦，即可慢慢去除，不留任何痕迹。